Id2.16.840.1.113883.10.20.20.3.2
ref
gtr-
Gültigkeit ab2013‑02‑01
Statusdraft EntwurfVersions-Label
NameGenomicSourceClassBezeichnungGenomic Source Class
Beschreibung
en-US The GenomicSourceClass template represents the genomic class of the specimen being analyzed: germline for inherited genome, somatic for cancer genome (e.g. DNA from tumor cells), and prenatal for fetal genome. These options are coded in LOINC and may be bound to the value attribute of this template.
KontextElternknoten des Template-Element mit Id 2.16.840.1.113883.10.20.20.3.2
KlassifikationCDA Entry Level Template
Offen/GeschlossenOffen (auch andere als die definierten Elemente sind erlaubt)
Assoziiert mit
Assoziiert mit 2 Konzepte
IdNameDatensatz
genea-dataelement-1.1510draft Probe draft GENeALYSE Datensatz
genea-dataelement-1.4110draft Klassifikation draft GENeALYSE Datensatz
Benutzt von / Benutzt
Benutzt von 1 Transaction und 6 Templates, Benutzt 0 Templates
Benutzt von als NameVersion
2.16.840.1.113883.3.1937.777.20.4.2Transaktiondraft en-US Genetic Testing Report (GTR) (DSTU Release 1)2018‑03‑22 11:37:04
2.16.840.1.113883.2.6.60.13.10.17Containmentdraft Untersuchungsmaterial Section2018‑10‑25 13:12:54
2.16.840.1.113883.10.20.20linkdraft Genetic Testing Report2013‑02‑01
2.16.840.1.113883.10.20.20.1.1linkdraft Summary Section2013‑02‑01
2.16.840.1.113883.10.20.20.1.7Containmentdraft Specimen Section2013‑02‑01
2.16.840.1.113883.10.20.20.1.8linkdraft Test Details Section2013‑02‑01
2.16.840.1.113883.10.20.20.2Containmentdraft Clinical Genomic Statement2013‑02‑01
BeziehungSpezialisierung: Template 2.16.840.1.113883.10.20.20.4 Genomic Associated Observation (DYNAMIC)
ref
gtr-
Beispiel
Beispiel
<observation classCode="OBS" moodCode="EVN">
  <templateId root="2.16.840.1.113883.10.20.20.3.2"/>  <id root="2.16.840.1.113883.18.12.7.30.9.3.7"/>  <code code="48002-0" codeSystemName="LOINC" displayName="Genomic source class"/>  <value xsi:type="CD" code="LA6683-2" codeSystemName="LOINC" displayName="Germline"/>  <specimen>
    <templateId root="2.16.840.1.113883.10.20.20.3.1"/>    <specimenRole>
      <specimenPlayingEntity>
        <code code="180796014" codeSystem="2.16.840.1.113883.6.96" codeSystemName="SNOMED-CT" displayName="Peripheral blood specimen"/>      </specimenPlayingEntity>    </specimenRole>  </specimen></observation>
ItemDTKardKonfBeschreibungLabel
hl7:observation
en-US GTR GenomicSourceClass (self) SHALL satisfy: If self.code.code=48002-0 (LOINC code for Genomic source class), then self.value.code SHALL be drawn from the LOINC answer list 48002-0.
CONFdotsR‑80
 
target
genea-dataelement-1.4110draft Klassifikation draft GENeALYSE Datensatz
@classCode
cs0 … 1FOBS
@moodCode
cs0 … 1FEVN
hl7:templateId
II1 … 1MCONFdotsR‑80
@root
uid1 … 1F2.16.840.1.113883.10.20.20.3.2
hl7:code
CD1 … 1RCONFdotsR‑81
@code
CONF0 … 1F48002-0
@codeSystem
0 … 1F2.16.840.1.113883.6.1
@codeSystemName
0 … 1FLOINC
@displayName
0 … 1FGenomic source class
hl7:value
CD0 … 1RCONFdotsR‑82
 CONF
Der Wert von @code muss gewählt werden aus dem Value Set 2.16.840.1.113883.10.20.20.9.12 Genomic source class (2013‑02‑01)
hl7:specimen
0 … 1Ren-US
It is important to explicitly associate the specimen information to the clinical genomic statement (or a reference the specimen structured data in a Specimen section if specified), because the specimen is not part of the header and even if specified in a Specimen section, it doesn't apply necessarily to other parts of the GTR body by the CDA context conduction rules.
CONFdotsR‑80
 
target
genea-dataelement-1.1510draft Probe draft GENeALYSE Datensatz
 Constrainten-US Contains exactly one [1..1] CDA Specimen